%%%%%%%%;
% This file lists the gene- and perturbagen-indices of;
% /data/rangan/dir_bcc/dir_CMAP/dir_reframe/filtered_modzs_signatures_24h_trtcp_A549_5uM.h5 ;
% in their order of importance, ;
% with the most important indices listed first (i.e., higher) in the file. ;
%%%%%%%%;
% First we list 180 of the gene-indices. ;
% These range from 0 up to 977 (i.e., they are zero-based). ;
% A line reading 'ng -1' refers to the ng-th landmark-gene, ;
% as listed in the file ;
% /data/rangan/dir_bcc/dir_CMAP/dir_reframe/clue_landmark_genes_20250822_tsv.txt ;
%%%%%%%%;
% In this file we only list the 634 perturbagens that are POSITIVELY correlated with the sub-signature. ;
% These range from 0 up to 12351 (i.e., they are zero-based). ;
% A line reading '-1 np' refers to the np-th perturbagen, ;
% as listed in the file ;
% /data/rangan/dir_bcc/dir_CMAP/dir_reframe/filtered_modzs_signatures_24h_trtcp_A549_5uM.h5 ;
%%%%%%%%;
231 -1
791 -1
584 -1
397 -1
806 -1
416 -1
445 -1
449 -1
468 -1
592 -1
765 -1
339 -1
281 -1
276 -1
147 -1
491 -1
168 -1
287 -1
718 -1
92 -1
133 -1
362 -1
881 -1
837 -1
343 -1
639 -1
808 -1
328 -1
962 -1
706 -1
316 -1
408 -1
770 -1
619 -1
737 -1
112 -1
91 -1
128 -1
672 -1
26 -1
465 -1
154 -1
781 -1
490 -1
747 -1
502 -1
282 -1
923 -1
915 -1
223 -1
113 -1
102 -1
435 -1
559 -1
790 -1
713 -1
749 -1
235 -1
219 -1
764 -1
306 -1
865 -1
739 -1
609 -1
301 -1
524 -1
674 -1
902 -1
454 -1
206 -1
549 -1
336 -1
341 -1
267 -1
381 -1
740 -1
930 -1
148 -1
683 -1
651 -1
285 -1
772 -1
787 -1
66 -1
143 -1
234 -1
530 -1
746 -1
255 -1
795 -1
177 -1
624 -1
807 -1
359 -1
596 -1
333 -1
817 -1
272 -1
724 -1
872 -1
859 -1
484 -1
197 -1
157 -1
379 -1
162 -1
217 -1
562 -1
836 -1
525 -1
794 -1
203 -1
812 -1
725 -1
61 -1
818 -1
358 -1
405 -1
883 -1
932 -1
72 -1
631 -1
254 -1
634 -1
831 -1
574 -1
895 -1
463 -1
901 -1
514 -1
846 -1
386 -1
469 -1
664 -1
742 -1
142 -1
855 -1
921 -1
536 -1
756 -1
702 -1
45 -1
908 -1
548 -1
98 -1
288 -1
376 -1
528 -1
171 -1
759 -1
743 -1
100 -1
647 -1
510 -1
243 -1
722 -1
495 -1
246 -1
29 -1
867 -1
797 -1
335 -1
717 -1
714 -1
110 -1
248 -1
473 -1
943 -1
93 -1
972 -1
612 -1
185 -1
541 -1
526 -1
675 -1
726 -1
352 -1
244 -1
216 -1
635 -1
-1 8307
-1 6417
-1 5498
-1 7657
-1 9509
-1 1352
-1 6319
-1 173
-1 9354
-1 39
-1 8185
-1 5330
-1 12248
-1 2757
-1 6441
-1 5825
-1 9399
-1 6478
-1 733
-1 2402
-1 4031
-1 252
-1 1334
-1 6359
-1 1984
-1 2336
-1 9450
-1 9515
-1 1488
-1 201
-1 200
-1 9550
-1 164
-1 9455
-1 192
-1 2468
-1 2264
-1 1517
-1 2044
-1 1962
-1 1142
-1 2359
-1 2341
-1 2403
-1 1875
-1 4485
-1 112
-1 1146
-1 6438
-1 2405
-1 2173
-1 9475
-1 2158
-1 1876
-1 1997
-1 1467
-1 2342
-1 6539
-1 25
-1 8204
-1 10835
-1 4562
-1 2396
-1 9432
-1 6300
-1 6318
-1 181
-1 1906
-1 9520
-1 172
-1 194
-1 189
-1 44
-1 2360
-1 3
-1 1944
-1 9534
-1 1926
-1 2424
-1 2680
-1 7453
-1 8195
-1 2410
-1 186
-1 6398
-1 2461
-1 9438
-1 2460
-1 2482
-1 2415
-1 24
-1 9216
-1 6282
-1 655
-1 688
-1 6497
-1 7230
-1 3928
-1 6358
-1 6537
-1 133
-1 150
-1 6540
-1 1277
-1 1952
-1 257
-1 214
-1 2458
-1 289
-1 686
-1 1089
-1 1065
-1 2431
-1 2426
-1 1990
-1 2385
-1 6419
-1 9410
-1 9413
-1 2331
-1 1687
-1 111
-1 161
-1 2444
-1 8155
-1 69
-1 42
-1 2364
-1 6520
-1 628
-1 8239
-1 28
-1 9452
-1 6498
-1 5610
-1 2174
-1 2324
-1 18
-1 1915
-1 178
-1 83
-1 2343
-1 37
-1 1738
-1 9646
-1 6519
-1 2400
-1 830
-1 6421
-1 4042
-1 6336
-1 1800
-1 61
-1 1314
-1 1922
-1 2422
-1 52
-1 630
-1 1890
-1 8299
-1 9411
-1 1430
-1 772
-1 8156
-1 9383
-1 6430
-1 8254
-1 2459
-1 2116
-1 827
-1 6397
-1 1464
-1 153
-1 6538
-1 9476
-1 162
-1 6476
-1 78
-1 1318
-1 54
-1 8329
-1 2457
-1 1528
-1 58
-1 17
-1 7469
-1 9535
-1 282
-1 2361
-1 1934
-1 8266
-1 4227
-1 1927
-1 1844
-1 9540
-1 1425
-1 1423
-1 9290
-1 2281
-1 9652
-1 645
-1 2129
-1 4497
-1 70
-1 12344
-1 9477
-1 1300
-1 1882
-1 11921
-1 1410
-1 706
-1 1275
-1 4033
-1 8162
-1 1912
-1 1414
-1 1913
-1 1408
-1 1301
-1 56
-1 3486
-1 2176
-1 9580
-1 279
-1 1918
-1 9532
-1 9471
-1 166
-1 57
-1 31
-1 5258
-1 9436
-1 9574
-1 1983
-1 208
-1 148
-1 6517
-1 9456
-1 8
-1 1932
-1 1545
-1 9417
-1 1902
-1 1335
-1 2161
-1 134
-1 2005
-1 1877
-1 76
-1 66
-1 1332
-1 259
-1 2289
-1 9552
-1 231
-1 1884
-1 8157
-1 67
-1 5360
-1 20
-1 155
-1 88
-1 75
-1 5630
-1 193
-1 1896
-1 1898
-1 1372
-1 1985
-1 5236
-1 137
-1 1895
-1 147
-1 47
-1 1917
-1 1916
-1 9512
-1 1949
-1 9527
-1 43
-1 6200
-1 9374
-1 10
-1 1417
-1 807
-1 38
-1 2166
-1 8031
-1 1466
-1 141
-1 691
-1 1404
-1 3474
-1 1390
-1 5139
-1 5755
-1 1893
-1 1881
-1 104
-1 9348
-1 1354
-1 171
-1 5832
-1 120
-1 158
-1 1986
-1 2
-1 9613
-1 10352
-1 1979
-1 4286
-1 5889
-1 9405
-1 5401
-1 5876
-1 6132
-1 1256
-1 9570
-1 1925
-1 1357
-1 9352
-1 1961
-1 9439
-1 9632
-1 9517
-1 1920
-1 1336
-1 9536
-1 10374
-1 9522
-1 1485
-1 21
-1 126
-1 9394
-1 4
-1 9454
-1 1360
-1 5254
-1 272
-1 2104
-1 1319
-1 238
-1 9650
-1 1793
-1 672
-1 10465
-1 2135
-1 19
-1 5627
-1 1939
-1 1267
-1 9559
-1 100
-1 7020
-1 9474
-1 5778
-1 1407
-1 6224
-1 1391
-1 116
-1 2047
-1 152
-1 1260
-1 5631
-1 5085
-1 1280
-1 1940
-1 5142
-1 1272
-1 9423
-1 2170
-1 1353
-1 5507
-1 5163
-1 803
-1 1398
-1 130
-1 1
-1 219
-1 278
-1 174
-1 7904
-1 5595
-1 5352
-1 1960
-1 72
-1 1929
-1 804
-1 1442
-1 1492
-1 22
-1 2172
-1 9531
-1 12177
-1 270
-1 9506
-1 9496
-1 5180
-1 1254
-1 9623
-1 1908
-1 1405
-1 9659
-1 785
-1 707
-1 784
-1 1393
-1 5178
-1 657
-1 11243
-1 1282
-1 2160
-1 5279
-1 1530
-1 1507
-1 5158
-1 92
-1 5358
-1 1462
-1 5125
-1 9376
-1 1265
-1 5456
-1 9656
-1 1512
-1 106
-1 9363
-1 5242
-1 5152
-1 1342
-1 1549
-1 1257
-1 5182
-1 6450
-1 5601
-1 2181
-1 89
-1 704
-1 228
-1 819
-1 9387
-1 735
-1 170
-1 6204
-1 1910
-1 9393
-1 1903
-1 872
-1 9398
-1 9558
-1 1298
-1 11305
-1 1313
-1 1431
-1 815
-1 11264
-1 5583
-1 661
-1 1481
-1 187
-1 10977
-1 843
-1 2003
-1 12239
-1 7068
-1 846
-1 1473
-1 1446
-1 2021
-1 1386
-1 1266
-1 9463
-1 33
-1 1795
-1 1283
-1 762
-1 9622
-1 889
-1 230
-1 9575
-1 71
-1 5800
-1 9539
-1 1296
-1 7290
-1 9555
-1 247
-1 640
-1 9579
-1 5407
-1 5608
-1 10539
-1 2128
-1 1959
-1 5593
-1 703
-1 9402
-1 2167
-1 6108
-1 5395
-1 5104
-1 2155
-1 1550
-1 5856
-1 5565
-1 121
-1 265
-1 9353
-1 1348
-1 1284
-1 5179
-1 1965
-1 5164
-1 663
-1 9434
-1 9358
-1 10333
-1 9403
-1 1899
-1 9424
-1 2136
-1 6087
-1 1919
-1 1293
-1 1251
-1 1368
-1 5793
-1 1303
-1 96
-1 851
-1 34
-1 6220
-1 1542
-1 1873
-1 9554
-1 1905
-1 849
-1 5364
-1 93
-1 16
-1 1389
-1 1263
-1 654
-1 1274
-1 251
-1 5035
-1 6984
-1 6940
-1 5607
-1 11265
-1 1928
-1 3604
-1 9640
-1 9381
-1 11324
-1 8153
-1 1548
-1 871
-1 716
-1 1887
-1 1907
-1 5934
-1 9582
-1 5549
-1 203
-1 7946
-1 15
-1 721
-1 1967
-1 232
-1 9428
-1 2724
-1 1445
-1 908
-1 683
-1 1305
-1 5604
-1 113
-1 1541
-1 2132
-1 5172
-1 9491
-1 8086
-1 5905
-1 9361
-1 1879
-1 5322
-1 10432
-1 9596
-1 10299
-1 9485
-1 9389
-1 9382
-1 7854
-1 127
-1 9379
-1 712
-1 2121
-1 1262
-1 5662
-1 2153
-1 9547
-1 9601
-1 5629
-1 7198
-1 281
-1 1458
-1 5614
-1 6203
-1 5030
-1 2064
-1 5272
-1 7802
-1 5005
-1 12303
-1 9400
-1 9614
-1 5202
-1 10301
-1 736
-1 5758
-1 5290
-1 5186
-1 9586
-1 795
-1 6381
-1 6116
-1 5190
-1 2024
-1 5508
-1 5571
-1 81
-1 933
-1 6230